这篇来自2013年特刊《在运输中》(In Transit)的文章及时介绍了一种来自一个地方的动物病毒如何感染全世界的人。
年代2004年的Ometime，一只猪用牧群用众所周东的屠宰场，香港最大的阿坝最大的屠宰场。它可能已经从中国任何数量的农场发货。猪在狭窄的条件下缠绕在狭窄的条件下，后来被驱逐到传送线上。当它到达线的末端时，它用颠簸电击到头部。一名工人伸出喉咙。在将胴体悬挂在链条上，烫伤和清洗后，科学家们将猪的嘴巴滑过作为流感监测计划的一部分，由香港大学经营。猪患上了一个看似无害的流感菌株。菌株被遗传上序，受洗的SW / HK / 915/04，进入数据库，遗忘。
五年后，一场源自猪的流感疫情通过航空旅行在全球范围内蔓延，从美国到巴西、中国到新西兰、南非到芬兰，造成近30万人死亡。科学家确定疫情始于墨西哥，离一个大型养猪场不远。研究数据库，寻找杀手病毒组成的蛛丝马迹，科学家们发现SW／HK／915／04，香港猪流感病毒株，共有八个基因中的七株，其中2009株为2009株。
2009年的流感疫情揭开了我们这个相互联系的世界的危险面纱。
共享基因建议科学家，2009年病毒可能通过在来自世界各地的猪中混合病毒菌株的基因组片段而发展。猪的全球出货量很少被追踪，研究人员没有建立受感染的香港猪与2009年墨西哥疫情之间的直接联系。“我们真的没有关于墨西哥的猪病毒信息，”基于Duke-Nus研究生医学院，新加坡国立大学的进化生物学家Gavin Smith说，领先作者本性论2009年流行病的起源。“这可能是在本地生成的，但遗传成分可能来自亚洲。”
史密斯呼应了国际卫生官员和科学家所说的是今天可能是病毒最令人担忧的方面：围绕全球旅行的缓和速度。他们说，2009年的流感流行病剥夺了面纱对我们相互关联的世界的危险。“病原体在我们的流动性与50至100年前的流动性与50至100年前的世界不同的世界中进化并传播，”西北大学理论物理学家德克布罗克曼说，他们研究传染病的传播，包括2009年病毒，分类为H1N1。“当一种病原体出现具有人类传播性的，如H1N1病毒，这是一种大规模的风险。”
T如今，工厂化的养猪场和屠宰场为病原体提供了大量的进化机会。事实证明，猪是真正的甲型流感的孵化器。甲型流感是一种常见的疾病，会导致发烧、嗜睡、流鼻涕，每年至少有数万人死亡。导致5000万人死亡的1918年和1919年西班牙流感是在猪体内进化而来，然后传染给人类的。2009年的H1N1病毒是甲型流感的一种亚型。
甲型流感通过接触、呼吸或血液从动物传播到人类，并在人与人之间传播。(煮肉可以杀死病毒。)迁徙的鸭子和其他水禽是甲型流感的最初携带者，它们彼此共享古老的病毒株。然而，一个人感染禽流感是相对困难的，反之亦然。但猪可以充当中间人。他们可以从鸟类、人类和其他猪身上感染甲型流感。
甲型流感通常包含八个基因片段。当不同的菌株交换基因片段时，它会迅速进化，产生新的突变品种。杜克·努斯大学的史密斯解释说：“当受感染的细胞复制时，单个基因片段可以从一种病毒中包装一个基因，从另一种病毒中包装七个基因。或者，实际上，任何其他组合。”
大多数突变株都是失败的。但有时，一个菌株是通过基因重组和重组产生的，这在达尔文的意义上比它的任何一个祖先都更“适合”。居住在2004香港猪体内的病毒及其在墨西哥的致命表兄弟是三重重组。他们将来自人类、猪和禽流感病毒株的基因组合成一个单一的毒株。
像香港上水这样的工厂化屠宰场，猪在被杀前被关在一起，加剧了这个问题。上水屠宰场建于一九九九年，旨在整合本港三间规模较小的屠宰场的运作，节省土地，并提高效率。生猪从中国的九个省份运到中国，以满足日益富裕的亚洲对肉类日益增长的需求。上水每天宰杀约五千头猪。
香港大学病毒学教授裴伟士(Malik Peiris)解释说，在过去，当猪被关在各自的农场时，流感毒株溃烂，但仍然处于相对隔离状态。现在，来自不同地区的猪被运送到一起，共享唾液、空气和细菌。它们结合在一起，形成了一个病毒中枢。“你不能把猪隔离起来，”佩里斯说，他在上水屠宰场负责监测流感病毒。“有机会从一组猪传播到另一组。”
佩里斯补充说，在国际范围内，“人们一直认为猪病毒不会四处传播。我是说，猪是不会飞的。”但是，他说，他的研究“清楚地显示了病毒从北美到中国，从欧洲到中国的传播”。他说，各国交换的种猪助长了病毒的传播。
“感染动物的运动确实增加了传播风险，”史密斯说。“危险是您在不同猪群中有不同类型的病毒。不同菌株的混合增加了病毒的多样性。“
T不过，猪本身并不会引发流行病。毕竟，病毒可以感染猪而不会引起比流鼻涕和发烧更严重的后果。事实上，由于病毒通常不会杀死成年猪，许多农民都懒得给它们接种疫苗。香港政府高级兽医官员雪莉·楚克(Shirley Chuk)表示:“这将是一种金钱浪费，因为他们没有重大的经济损失，所以没有足够的理由来证明接种疫苗的合理性。”最好的防御是防止流感从猪传染给人。“对于农民，我们总是建议他们注意个人卫生，”查克说。
但当然这是从来没有足够的。科学家们无法确定2009年的H1N1如何从猪跳到人类。但他们确实知道，一旦它所做，现代航空旅行成为病毒高速公路。
现在，来自不同地区的猪被运送到一起，共享唾液、空气和细菌。它们结合在一起，形成了一个病毒中枢。
麻省理工学院(Massachusetts Institute of Technology)研究复杂网络中的动态过程的博士生克里斯托·尼克莱德斯(Christos Nicolaides)说，问题始于机场。一个主要因素是机场的“交通场”，它描述了一个机场与其他机场的互联性。可以预见，纽约和洛杉矶是“有影响力的传播者”。但夏威夷也是如此，它的空中交通量比纽约少30%。夏威夷位于太平洋中部，与世界上许多主要枢纽相连。一旦一个病人出现在夏威夷候机室，对着其他旅客咳嗽，疾病就会迅速扩散到世界上其他主要航空枢纽，甚至更远。
研究2009年疫情的西北物理学家布罗克曼说，关注基于空中交通的城市之间的相互联系，而不是它们之间的距离，是理解疫情如何转移的关键。他说，为了理解现代流行病，我们需要从“有效距离”的角度来看待世界
在传统意义上，伦敦和纽约相距3500英里，而伦敦和爱丁堡相距约400英里。但如果你凭直觉判断城市之间的联系，考虑到它们之间的空中交通，伦敦和纽约实际上是近邻，而伦敦和爱丁堡是远亲。
布罗克曼指出，流行病通过流动网络在全球迅速蔓延。2009年4月，当美国疾病控制与预防中心(Centers for Disease Control and Prevention)发布了关于H1N1病毒的公众警报时，布罗克曼将他的方法应用到了这场流行病中。在发布警报后的两周内，他预测了一种最糟糕的情况(即没有采取任何措施来控制疾病)，即H1N1将在美国的哪些地方传播。根据空中交通数据和人口统计数据，他确定了墨西哥城是疾病的中心，他预测9万流感病例将集中在5个地区或“热点”:南加州、达拉斯、东北部、芝加哥和迈阿密。与CDC的最终数据相匹配，布罗克曼的预测非常准确。CDC的最终数据显示，在疫情爆发的最初几周，全国各地的确诊病例和疑似病例都有。只有迈阿密被证明是一个错误的计算，尽管该地区的感染人数在2009年夏天确实呈指数级增长。
C学习的数学预测关于Pandemics如何传播有价值。如果疾病震中未知，Brockmann表示，他可以与他的计算机模拟进行一种逆向工程，从报告感染的区域开始。“我们可以确定震中的位置，我们可以预测疾病将到达某个地方，”他说。不幸的是，数学预测无法阻止大流行。
2011年，意大利科学交流研究所(Institute for Scientific Interchange)、波士顿东北大学(Northeastern University of Boston)和法国国立卫生与医学研究所(National Institute of Health and Medical Research)的一个国际计算流行病学家团队分析了2009年的全球大流行。他们审查了世界各国制定的前往墨西哥的旅行禁令、机场对可能感染病毒的乘客的检查，以及禁止前往墨西哥的建议。国际警报发布一个月后，他们确定进出墨西哥城的国际空气流量下降了40%。然而，这40%的下降只“导致其他国家(即首例输入病例)平均延迟不到三天”。科学家们接着预测，如果90%的往返墨西哥的航空旅行都受到限制，会发生什么情况，结果也没有多大希望——90%的限制最多只能将传播推迟20天。
他们的报告《人类流动网络、旅行限制和2009年H1N1大流行的全球传播》发表在该杂志上普罗斯一体，科学家们给出了一个可怕的结论:“鉴于人们的流动性不断增加，旅行限制不太可能在未来的大流行事件中有效使用。”
计算机科学家、病毒学家和微生物学家对阻止未来大流行的严峻前景持相同看法。他们说，流行病是全球流动性的黑暗面。史密斯是一位不苟言和的科学家，他指出，有一个“极端的选择”。“阻止感染传播的最好方法是停止旅行，”他说。
John Upton是伙伴关系新闻编辑气候中心．
